مقدمه: تاکنون بر روی کفال ماهیان حوزه شمالی خلیج فارس کار ژنتیکی انجام نشده است؛ گونه های متعلق به خانواده کفال ماهیان از نظر شکل ظاهری بسیار به یکدیگر شبیه می باشند، به همین دلیل طبقه بندی این ماهیان بر اساس ویژگی های مورفولوژیک، همواره با اشکال توام بوده است. هدف: لذا در این تحقیق با استفاده از روش های مولکولی سعی نموده تا حدودی به رفع این مشکل کمک شود. روش کار: در این بررسی تعداد 16 عدد ماهی کفال Liza abu و Liza subviridis از حوزه شمالی خلیج فارس (استان های خوزستان و بوشهر) جمع آوری گردید و DNA آنها با روش فنل- کلروفرم با استفاده از کیت DNAFAST استخراج شد. قطعه ژنوم مورد نظر (ناحیه D-loop در (mtDNA توسط پرایمرها در فرآیند PCR تکثیر یافت. محصول PCR بر روی ژل آگارز 1٪ بعد از مشاهده، خالص گردید و پس از تعیین چینش، درخت فیلوژنتیکی مربوط به این گونه ها ترسیم گردید. نتیجه: با مطالعه درخت فیلوژنتیک می توان دریافت که گونه های L. abu و L. subviridis در 2 شاخه جدا از یکدیگر قرار گرفته اند و ویژگی های مورفولوژیکی آنها منطبق بر مطالعات ژنتیکی می باشد.